Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms