Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms