Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC011379.2-201ENST00000523154 583 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SCAND2P-204ENST00000541103 669 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC005871.2-201ENST00000549104 526 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC118658.1-201ENST00000560221 334 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC013565.2-201ENST00000564874 310 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF254-201ENST00000339642 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP264-201ENST00000411080 289 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL7L1P12-201ENST00000417594 729 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC005261.1-201ENST00000601567 712 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC025031.3-201ENST00000611566 368 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CPA2-201ENST00000222481 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 IKZF3-205ENST00000350532 1413 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 IKZF3-206ENST00000351680 1413 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TMEM139-202ENST00000409102 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms