Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SGCZQ96LD1 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SGCZQ96LD1 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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