Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RGS17-201ENST00000206262 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RTP3-201ENST00000296142 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 USP46-207ENST00000508499 1419 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC01865-201ENST00000430529 845 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL590609.1-201ENST00000442164 328 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC068531.1-201ENST00000502398 195 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00681-201ENST00000530150 504 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL136038.5-201ENST00000620835 554 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 NAALAD2-204ENST00000525171 1613 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSPP1Q1MSJ5 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms