Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SPHKAPQ2M3C7 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SPHKAPQ2M3C7 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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SPHKAPQ2M3C7 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
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SPHKAPQ2M3C7 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SPHKAPQ2M3C7 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SPHKAPQ2M3C7 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SPHKAPQ2M3C7 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SPHKAPQ2M3C7 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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