Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 NCALD-212ENST00000519508 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LINC02219-201ENST00000520762 454 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC124276.2-201ENST00000527997 550 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LDHC-207ENST00000541669 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CCNJL-208ENST00000541762 2965 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 C6orf229-201ENST00000565469 814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC016590.2-201ENST00000592319 375 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC093107.2-201ENST00000603668 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC008013.3-201ENST00000605711 675 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL158071.4-201ENST00000608358 4125 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CD200R1L-205ENST00000617549 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AP000457.1-201ENST00000620221 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CABYR-218ENST00000627314 1622 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 WDR55-201ENST00000358337 4080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 OR7A17-203ENST00000642123 3565 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CCDC13-AS1-201ENST00000418161 2049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 U3.16-201ENST00000384391 209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC132008.1-201ENST00000394682 286 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CRYZL1-206ENST00000413017 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 SNX25P1-201ENST00000441817 834 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL662795.1-201ENST00000448756 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 IGKV1-12-201ENST00000480492 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 IGKV1-17-201ENST00000490686 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC126182.2-201ENST00000496098 339 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PSEN1P49768 FGF12-AS1-202ENST00000530635 555 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC025576.2-201ENST00000535806 390 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC104261.1-202ENST00000557946 509 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC131391.1-201ENST00000565359 520 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 IGHV1OR15-6-201ENST00000603166 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 AC027575.4-201ENST00000622010 586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 SMG6-IT1-201ENST00000624930 374 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 PTPN12-203ENST00000415482 2316 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PSEN1P49768 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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