Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC01718-201ENST00000441660 391 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC013391.3-201ENST00000567484 1456 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CFAP65-202ENST00000341552 5953 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 RASGRP3-201ENST00000402538 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MTND6P16-201ENST00000504006 520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
XIRP2A4UGR9 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms