Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL359547.1-201ENST00000419168 2190 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CD200-202ENST00000383681 1997 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TTLL7-201ENST00000260505 7976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC011294.1-202ENST00000451905 1947 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms