Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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C9orf40Q8IXQ3 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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C9orf40Q8IXQ3 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 VSIG1-201ENST00000217957 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
C9orf40Q8IXQ3 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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