Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DIO2-AS1-201ENST00000553979 1597 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL353622.1-201ENST00000604716 1945 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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