Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C4BP0C0L5 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C4BP0C0L5 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C4BP0C0L5 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C4BP0C0L5 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C4BP0C0L5 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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