Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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