Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIAS3Q9Y6X2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms