Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA3Q9Y6Q9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms