Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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SNX13Q9Y5W8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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