Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A3BPQ9Y5P4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms