Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB2Q9Y5E7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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