Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS2Q9Y248 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms