Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGSF9BQ9UPX0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms