Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD1Q9UP38 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD1Q9UP38 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms