Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP18Q9UMW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP18Q9UMW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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