Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRPF3Q9ULD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRPF3Q9ULD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms