Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms