Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL4Q9UJQ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms