Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms