Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms