Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIP2Q9UDT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms