Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LPAR3Q9UBY5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms