Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX3Q9UBR4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX3Q9UBR4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms