Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFIP11Q9UBB9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms