Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms