Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNKQ9P0W0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms