Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GDE1Q9NZC3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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