Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNK4Q9NYG8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms