Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM248Q9NWD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms