Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BSDC1Q9NW68 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSDC1Q9NW68 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms