Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCLQ9NW38 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCLQ9NW38 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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