Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms