Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATAD3AQ9NVI7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms