Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms