Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms