Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC4Q9NTJ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms