Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms