Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPRSS4Q9NRS4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms