Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2TQ9NPD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms