Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms