Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX1Q9NP08 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX1Q9NP08 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms