Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms