Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL44Q9H9J2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL44Q9H9J2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms